细菌、病毒、真菌、寄生虫等，均可引起孩子感染性发热，累及的部位可以是多个方面的，如：肺部感染、胆道系统感染、泌尿系感染、心内膜炎等。这类原因引起的发烧，通过临床表现和实验室检查可提供诊断线索。
比如，受细菌感染时，患儿可出现长期发热伴畏寒及寒颤，还有一些患儿可出现出血点、斑疹、丘疹或荨麻疹等皮疹，实验室检查可见外周血白细胞及中性粒细胞明显增加，血、骨髓培养等病原学检查或聚合酶链反应（PCR）可帮助找出病原菌。
再如，小儿病毒感染时以EB病毒和巨细胞病毒为多见，EB病毒感染时，患儿可出现发热、咽峡炎、淋巴结肿大，还有一些病例可出现肝脾大、多样性皮疹等表现，实验室检查可发现外周白细胞增多和变异淋巴细胞增多的血象改变、检测EB-IgM、血噬异凝集试验有诊断价值。
此外，结核杆菌引起的慢性感染性疾病也是引起小儿长时间发热的常见感染性疾病之一，尤其是有家庭病史的患儿，如果长期低热、轻咳、盗汗、乏力、食欲减退、消瘦等，更需及早做影像学检查及实验室检查以助诊断。
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